Conexx-Europe cuenta con varias contrapartes tanto en Europa con América Latina

A nivel de universidades, Conexx-Europe es fundador de Access4Lat donde ofrece apoyo técnico a las universidades miembros del portal Universia que desean acceder a recursos europeos destinados a proyectos de investigación y desarrollo. Esta plataforma agrupa universidades de América Latina, España y Portugal.

A nivel de cooperación al desarrollo, Conexx tiene en su red varios tipos de estructuras como fundaciones, ONGs, asociaciones, e Instituciones representativas como Forum TrEES, la Comisión Europa, gobiernos nacionales y sus entidades administrativas. Además Conexx tiene acuerdos estratégicos con consultoras y centros de investigación europeos y latinoamericanos.